Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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