Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp30Q3UN04 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms