Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf149Q3U2C5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms