Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Q3U1D9 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Q3U1D9 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Q3U1D9 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Q3U1D9 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Q3U1D9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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