Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms