Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccndbp1Q3TVC7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccndbp1Q3TVC7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ccndbp1Q3TVC7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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