Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms