Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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