Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms