Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms