Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab42Q0PD08 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms