Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc21bQ0HA38 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ttc21bQ0HA38 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc21bQ0HA38 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms