Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Kcnma1Q08460 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kcnma1Q08460 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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