Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Igsf9Q05BQ1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Igsf9Q05BQ1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Igsf9Q05BQ1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms