Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms