Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gjb2Q00977 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms