Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SeleQ00690 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms