Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smn1P97801 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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