Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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