Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gbx1P82976 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms