Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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SgcgP82348 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SgcgP82348 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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