Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Irx1P81068 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms