Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx3P81067 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms