Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lmo4P61969 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms