Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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CckbrP56481 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CckbrP56481 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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CckbrP56481 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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