Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdgfP51859 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HdgfP51859 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HdgfP51859 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HdgfP51859 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HdgfP51859 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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HdgfP51859 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HdgfP51859 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdgfP51859 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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HdgfP51859 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HdgfP51859 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdgfP51859 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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HdgfP51859 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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HdgfP51859 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HdgfP51859 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms