Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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