Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms