Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Rpl28P41105 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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