Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms