Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms