Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa5P28312 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms