Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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