Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms