Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18530 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
P18530 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P18530 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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