Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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