Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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