Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tgfb1P04202 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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