Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MscO88940 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MscO88940 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MscO88940 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MscO88940 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MscO88940 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MscO88940 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
MscO88940 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms