Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms