Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms