Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ldb2O55203 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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