Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Cited2O35740 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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