Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NudcO35685 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NudcO35685 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NudcO35685 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NudcO35685 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NudcO35685 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NudcO35685 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms