Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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