Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KeraO35367 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KeraO35367 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
KeraO35367 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms