Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms