Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm2035J3QP87 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms