Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim18J3QNP2 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim18J3QNP2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim18J3QNP2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Smim18J3QNP2 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim18J3QNP2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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