Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Bbip1J3QMK2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms